华大生命科学研究院

共议时空组学未来发展 华大参加2024时空组学联盟大会

发布日期:2024/07/19

7月8日至9日,2024年时空组学联盟(STOC)大会在新加坡隆重召开,来自40个国家和地区、163个机构,超过270位科学家和业内人士,以线上和线下的方式参会,围绕“技术/算法/数据集成”、“神经生物学”、“癌症”等热门话题,分享和探讨时空组学领域的最新成果和突破,共同商议时空组学联盟下一步的发展方向。


华大生命科学研究院院长、时空组学联盟科学委员会科学领袖和联盟组织委员会成员徐讯,华大集团副总裁、时空组学联盟主要组织者、执行办公室负责人刘伟斌致开幕辞,华大生命科学研究院生物信息首席科学家、生物智能技术研究所所长黎宇翔,单细胞组学首席科学家刘龙奇,时空组学领域首席科学家、生物化学技术研究所所长陈奥,数字化地球研究所主任科学家夏科科分别作科研成果分享并参与学术讨论。华大集团董事长、联合创始人汪建出席。



7月8日,在开幕致辞环节,刘伟斌对各位国际专家学者的莅临表示欢迎。他提到,如今,科学家们正将空间和时间的维度加入基因组学的研究,迎来了生命科学新的飞跃。我们需要最优秀的科学家、工程师、数学家的共同努力,充分利用最先进的技术,以及底层的解决方案,在全球范围内以科学为驱动,用包容和公平的方式开展合作和研究,才能吸引和鼓励这一大科学项目所需的资源和人才,才有可能实现这些伟大的科学目标。



徐讯在致辞中介绍了时空组学联盟每个工作组的任务和挑战,并阐述了本次会议的目标。他指出时空组学联盟是一个中立、开放、非盈利性质的组织,秉持标准化、先驱性、创新性和社会责任的价值观。徐讯强调,标准化对科研的可比性、可重复性和可参考性意义重大,时空组学的很多研究都是开创性的,需要全领域的科学家勇于创新和突破,在这一方面时空组学联盟承担了重要的社会责任。



时空组学联盟科学委员会的另一科学领袖,澳大利亚昆士兰大学基因组学与机器学习实验室主任、免疫空间组织智能中心主任Quan Nguyen介绍了空间组学的全球机遇和挑战。他强调了学术界、临床医生和行业合作伙伴之间全球合作的必要性,以便共同构建技术创新的渠道,为技术的快速转化铺平道路,造福更多患者。



中国医学科学院血液学研究所程涛介绍了单细胞RNA测序和多组学技术在血液生态系统研究中取得的显著进展,使得科研人员能追溯造血干细胞的起源,展示造血干/祖细胞的发育动态,揭示移植后的造血重建,以及解析良性和恶性血液疾病的特征。他还提到他和他的团队正在与华大合作,利用华大的时空组学技术,绘制骨髓等器官的空间图谱,进一步拓宽对血液疾病发病机制和临床治疗的理解。



在圆桌讨论环节,徐讯作为时空组学联盟科学委员会的科学领袖之一,和其他成员共同带领与会人士围绕“样本和技术”、“分析和集成”、“数据获取和共享”等主题展开圆桌讨论。其中,陈奥介绍了在纳米分辨率下开展时空多组学研究的技术进展。



在最新技术分享环节,黎宇翔就华大最新研发的DCS Cloud数据处理平台进行了介绍。通过DCS Cloud进行分析,不同的团队可以共同访问同一个数据,这能有效解决跨机构科研合作的海量数据共享和访问问题,从而提高合作效率,并降低数据存储成本。



在7月9日的成果发表环节,刘龙奇就利用时空组学进行大脑细胞图谱绘制的研究成果进行了主题汇报。他表示,通过STOC神经工作组(STOC-Neuro)和“全脑介观神经联接图谱” 国际大科学计划(MBCP)这两大平台,相关领域的科学家们已经建立了一个基于细胞与空间多组学的全球协作网络。通过构建人类、非人灵长类动物、哺乳动物和低等生物的大脑细胞时空图谱,科学家们有机会研究大脑的细胞分辨率结构和功能、病理状态下的细胞变化机制、发育过程中细胞命运的调控以及物种进化过程中细胞类型的变化。此外,研究团队还开发了相关的大脑图谱数据库,为促进全球数据共享和脑研究协作提供了宝贵的资源。



此外,夏科科分享了近期成立的植物时空组学联盟(STOC-Plant)的最新情况。植物时空组学联盟作为时空组学联盟的子联盟,将聚焦植物时空组学重大科学问题研究,致力于搭建一个开放合作、数据共享的国际科研组织,积极推动制定时空组学技术在植物研究中的应用标准。作为植物时空组学联盟的共同发起方和重要成员之一,华大将持续助力联盟加强学术交流、传播前沿知识、促进科研协作,通过领先的时空组学技术助力全球科研人员取得更多突破成果。



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