华大生命科学研究院

共建基因数据压缩标准AVS-G

发布日期:2020/10/15

随着测序成本的降低和通量的提高,基因数据存储面临着巨大挑战,而目前基因数据压缩软件参差不齐,无法在行业中应用起来,导致目前基因测序数据压缩仍然以传统的通用压缩工具gzip作为标准压缩工具,带来了巨大的存储浪费。针对以上问题,华大生命科学研究院和鹏城实验室牵头在2018年联合深圳大学、西安科技大学、人和未来等国内高校和行业机构,在国内著名的AVS(数字音频视频编码技术标准工作组)下成立的基因数据压缩专题标准工作组,以期望能够为行业提供一套基因数据压缩标准,解决基因行业数据压缩问题,为未来海量基因数据存储节约空间。


随着工作的开展,目前工作组已经收到数十份提案,并采纳了多份提案,包含了基因数据存储格式、压缩和解压整体框架,碱基和质量值压缩等多个方面。目前工作组正在进行reference tool的开发工作,相信不久便能提供给行业使用。


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